Editado a cada seis anos, o Plano faz um diagnóstico da pós-graduação nacional. A partir desta avaliação, apresentam-se propostas de diretrizes, cenários de crescimento do sistema, metas e orçamento para a execução de ações. A versão atual do PNPG compreende o período de 2005 a 2010.

Para a elaboração do Plano, institui-se uma comissão, formada por representantes de todos os segmentos que atuam na pós-graduação: universidades e pró-reitorias, sociedades científicas, coordenadores de programas e cursos de pós-graduação, representantes de área da Capes, comitês assessores do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), comitês gestores dos fundos setoriais do Ministério da Ciência e Tecnologia (MCT), Associação Nacional de Pós-Graduandos e setor empresarial. O PNPG também passa por discussão em encontros promovidos em instituições de ensino superior selecionadas por membros da comissão.

Concluídos os trabalhos, a proposta do PNPG é apresentada ao Conselho Superior da Capes. O último ato é a aprovação pelo ministro da Educação.

O Plano Nacional de Pós-Graduação PNPG 2005-2010 foi elaborado por uma Comissão instituída pelo presidente da Capes, Jorge Almeida Guimarães. Esta Comissão foi presidida por Francisco César de Sá Barreto, indicado pelo Conselho Superior da Capes e composta por: Emídio Cantídio de Oliveira Filho (indicado pelo Conselho Superior da Capes); Sandoval Carneiro Júnior (indicado pelo Conselho Técnico Científico - CTC e Conselho Superior da Capes); Carlos Benedito Martins (indicado pela Diretoria Executiva da Capes); Carlos Roberto Jamil Cury (indicado pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq); Ricardo Gatass (indicado pela Financiadora de Estudos e Projetos - Finep); José Ricardo Bergmann (indicado pelo Fórum Nacional de Pró-Reitores - Foprop); Glaci Theresinha Zancan (representante da comunidade acadêmica); Luciano de Rezende Moreira (representante da Associação Nacional de Pós-Graduandos); Ricardo Sebastião Lourenço (indicado pela Diretoria Executiva da Capes).

Concluídos os trabalhos, a proposta do PNPG foi encaminhada ao presidente da Capes no dia 2 de dezembro de 2004 e no dia 9 foi apresentada ao Conselho Superior da Capes, tendo sido aprovada integralmente.

O Plano Nacional de Pós-Graduação-PNPG 2005-2010 foi aprovado pelo Ministro da Educação, Tarso Genro, no dia 5 de janeiro de 2005.