I - Órgãos de assistência direta e imediata ao Presidente:

a) Gabinete (GAB):

1. Assessoria de Planejamento e Consolidação da Informação (APE);
2. Coordenação de Comunicação Social (CCS);
3. Coordenação Executiva dos Órgãos Colegiados (CECOL);

II - Órgãos seccionais:

a) Procuradoria Federal (PF):

1. Coordenação de Matéria Finalística (CMF):

b) Auditoria Interna (AUD);

c) Diretoria de Gestão (DGES):

1. Coordenação Geral de Execução Financeira, Orçamentária e de Contabilidade (CGOF):

1.1. Coordenação de Execução Orçamentária e Financeira (COF);
1.2. Coordenação de Contabilidade (CCONT);
1.3. Coordenação de Prestação de Contas (CPC):
1.3.1. Divisão de Auxílios (DAUX);
1.3.2. Divisão de Convênios e Descentralizações (DCONV);

2. Coordenação Geral de Gestão de Pessoas (CGGP):

2.1. Coordenação de Desenvolvimento de Pessoas (CDP):
2.1.1. Divisão de Saúde Ocupacional e Qualidade de Vida (DSO).
2.2.Coordenação de Administração de Pessoal (CAP).

3. Coordenação Geral de Recursos Logísticos (CGLOG):

3.1. Coordenação de Serviços Administrativos (CSA);
3.1.1. Divisão de Patrimônio e Almoxarifado (DPA):
3.1.2. Divisão de Passagens Aéreas e Terrestres (DPAT):
3.1.2.1. Seção de Transportes (STR).
3.2. Coordenação de Gestão de Documentos (CGD):
3.2.1. Seção de Protocolo e Expedição (SPE)
3.3. Coordenação de Suprimentos (CSUP);
3.3.1. Divisão de Compras e Licitação (DCOL);
3.4 Coordenação de Contratos (CCO).

d) Diretoria de Tecnologia da Informação (DTI):

1. Coordenação Geral de Sistemas (CGS):

1.1. Coordenação de Sistemas de Auxílios, Bolsas e Convênios (CSAB);
1.2. Coordenação de Sistemas da Avaliação da Pós-Graduação (CSAPG);
1.3. Coordenação de Sistemas de Apoio a Educação (CSAE);

2. Coordenação Geral de Infraestrutura de Informática (CGII):

2.1. Divisão de Suporte ao Usuário (DSU);
2.2. Divisão de Administração de Redes (DAR);

III - Órgãos específicos singulares:

a) Diretoria de Programas e Bolsas no País (DPB):

1. Coordenação Geral de Desenvolvimento Setorial e Institucional (CGSI):

1.1. Coordenação de Apoio Institucional à Pós-Graduação (CPG);
1.2. Coordenação de Programas de Apoio a Excelência (CEX);
1.3. Coordenação de Apoio ao Aperfeiçoamento de Docentes (CAD).

2. Coordenação Geral de Programas Estratégicos (CGPE):

2.1. Coordenação de Programas de Indução e Inovação (CII);
2.2. Coordenação de Programas Especiais (CPE).

3. Coordenação Geral de Acompanhamento de Programas e Supervisão de Resultados (CGSR):

3.1. Divisão de Supervisão de Resultados (DSR);
3.2. Divisão de Acompanhamento de Auxílios e Convênios (DAC).

4. Coordenação Geral do Portal de Periódicos (CGPP):

4.1. Divisão de Execução, Acompanhamento e Fiscalização (DEA);

b) Diretoria de Avaliação (DAV):

1. Coordenação Geral de Avaliação e Acompanhamento da Pós-Graduação (CGAA):

1.1. Coordenação de Avaliação e Acompanhamento da Área I – Colégio de Ciências da Vida (CAA I);
1.2. Coordenação de Avaliação e Acompanhamento da Área II – Colégio de Humanidades (CAA II);
1.3. Coordenação de Avaliação e Acompanhamento da Área III - Colégio de Ciências Exatas, Tecnológicas e Multidisciplinar (CAA III);
1.4. Coordenação de Normatização da Avaliação (CNA);

2. Coordenação Geral de Atividades de Apoio à Pós-Graduação (CGAP):

2.1. Coordenação de Gestão da Informação (CGI):
2.1.1. Divisão de Gerenciamento de Dados (DGD);
2.2. Coordenação de Apoio Executivo à Avaliação (CEA):
2.2.1. Divisão de Apoio à Avaliação (DAA);

3. Coordenação Geral de Acompanhamento e Avaliação do Mestrado Profissional (CGNE):

3.1. Divisão de Estudos e Pesquisas (DEP);

c) Diretoria de Relações Internacionais (DRI):

1. Coordenação Geral de Programas (CGPR):

1.1. Coordenação de Parcerias Estratégicas no Norte Global e Oceania (CPET);
1.2. Coordenação de Parcerias com Europa Latina e para o Desenvolvimento (CPAD);

2. Coordenação Geral de Bolsas e Projetos (CGBP):

2.1. Coordenação de Candidaturas a Bolsas e Auxílios no Exterior (CCE);
2.2. Coordenação de Acompanhamento de Bolsistas no Exterior (CAB);
2.2.1 Divisão de Prestação de Contas (DPC);

3. Coordenação Geral de Acompanhamento e Monitoramento de Resultados (CGMR):

3.1. Divisão de Monitoramento de Resultados (DMR);
3.2. Divisão de Acompanhamento de Egressos (DAE)

d) Diretoria de Formação de Professores da Educação Básica (DEB):

1. Coordenação Geral de Programas de Valorização do Magistério (CGV):

1.1. Coordenação de Apoio à Inovação e à Pesquisa em Educação (CINPE);
1.2. Coordenação de Valorização da Formação Docente (CVD);

2. Coordenação Geral de Formação de Docentes da Educação Básica (CGDOC):

2.1. Coordenação de Apoio à Formação de Profissionais do Magistério (CAF);
2.2. Coordenação de Apoio a Programas de Valorização das Licenciaturas (CAL);

e) Diretoria de Educação à Distância (DED):

1. Coordenação Geral de Inovação em Ensino a Distância (CGIE):

1.1. Coordenação de Apoio a Polos (COAP);
1.2. Coordenação de Tecnologia em Educação a Distância (CTED);

2. Coordenação Geral de Programas e Cursos em Ensino a Distância (CGPC):

2.1. Coordenação de Articulação Acadêmica (CAAC);
2.2. Coordenação de Programas, Cursos e Formação em Ensino a Distância (CPCF);

3. Coordenação Geral de Supervisão e Fomento (CGFO):

3.1. Coordenação de Supervisão e Fomento (CSF);
3.2. Coordenação de Concessão de Bolsas (CCB);

IV - Órgão executivo:

a) Diretoria Executiva (DEX);

V - Órgãos colegiados:

a) Conselho Superior (CS);

b) Conselho Técnico Científico da Educação Superior (CTC-ES);

c) Conselho Técnico Científico da Educação Básica (CTC-EB).